二.公關部：分為募款組及宣傳組。募款組負責尋求贊助經費來支援藥聯會所舉辦的各項活動；宣傳組則負責宣傳藥聯會的所有活動。
三.編輯部：負責七所藥學系資訊以及所提供的消息，彙整於七藥特刊中
四.資訊部：分為網路管理跟資料庫。網路管理司處理聯會本身所屬的網站；而資料庫則是提供有關藥學的相關資料，包含了書籍以及所發表的文章等等，以利於學生查詢。
五.財務部：編列藥聯會所有預算開支並記錄掌控藥聯會所有收納跟支出。
六.公共衛生部：負責宣導公共衛生方面事務，如反菸的宣導、愛滋的防範及肺結核的傳染途徑與其預防措施等等。
七.學生交換事務部：總理本國之藥學生交換計畫，與世界藥學生聯會(IPSF)學生交換計畫之接軌，各校交換官並須負責該學校之學生交換計畫之執行。
八.章程修訂委員會：負責章程之解釋，增修提案之評估及增修提案評估結果的報告。
九.藥學教育部：總理藥學生學習環境及一切相關藥學生教育事項。
十.大藥盃籌備會：負責大藥盃之籌畫。
十一.培訓營籌備會：負責規劃舉辦培訓營。
十二.藥學年會籌備會：負責藥學年會之籌備事宜。
十三.2007IPSF籌備委員會：目前正積極爭取2007年世界藥學生年會於台灣舉辦。
二.培訓營：使藥學生了解國內藥學教育近況及所需，培養參與世界藥學組織的興趣與能力，逐漸建立起國際觀並增進藥學生在公眾事務上的努力與服務，甚至提昇台灣未來藥師對國際衛生健康之視野。
三.大藥盃：由七所藥學系的學生共同參加的體育競賽，藉此有更多互動以增進彼此的感情，也表現出藥學生在課後之餘藉由運動來抒發身心的一面。
四.公共衛生：配合IPSF每年不同的宣導主題進行公共衛生的推廣活動，例如：愛滋病、肺結核及防治菸害等。
五.藥學教育：努力替藥學生爭取良好的學習環境與教育制度。
六.IPSF學生交換計畫：於國外的社區及醫院藥局、行銷單位、藥廠、政府，或在私立醫療單位內進行實習。此外，還有很多關於我們本科藥學專業的資訊以及許多課程及演講，都會提昇我們的專業能力以及認知。不只能學得藥學專業知識外，更能體驗異國的教育文化、拓展藥學生的視野及社交經驗。這個計畫原則上持續一年，但實際上大多在三月到九月間進行交流，每次約一到三個月。申請條件為藥學系在學學生或大學畢業後四年之藥師。
二.提昇大眾用藥的知識
三.促使藥師社會地位提昇